O Programa de Pós-Graduação em Modelagem Computacional (PPGMC) , o primeiro no país nesta área, teve o mestrado credenciado pela CAPES em 1995 e o doutorado em 2000.

A modelagem computacional é uma área do conhecimento que trata da aplicação de modelos matemáticos e soluções numéricas à análise, compreensão e estudo da fenomenologia de problemas complexos em áreas tão abrangentes quanto as Engenharias, Ciências Exatas, Ciências Biológicas e Ciências Humanas.

Os cursos de Mestrado e Doutorado do PPGMC do IPRJ/UERJ foram avaliados com o conceito 6 nos últimos oito anos pela CAPES. A maior nota atribuída pela CAPES é 7. Estes cursos são considerados de excelência e recebem bolsas das agências de fomento brasileiras.